以下 R 手冊是在 Debian Linux 上建立，可能與 Mac 或 Windows 上特定平台頁面的手冊不同，但大部分內容在所有平台上都是相同的。每個平台手冊的正確版本都是個別 R 安裝的一部分。手冊會隨著 R 而改變，因此我們提供最新發布的 R 版本（R-release）、已修補版本（R-patched）的最新版本，以及仍在開發中的未來 R 版本（R-devel）。
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| 手冊 | R-release | R-patched | R-devel |
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| R 簡介基於以前的「R 筆記」，介紹這門語言，以及如何使用 R 進行統計分析和繪製圖形。 | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB |
| R 資料匯入/匯出說明 R 本身或透過 CRAN 提供的套件中可用的匯入和匯出功能。 | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB |
| R 安裝與管理 | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB |
| 撰寫 R 擴充套件涵蓋如何建立您自己的套件、撰寫 R 說明檔案，以及外國語言（C、C++、Fortran 等）介面。 | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB |
| R 語言定義草稿文件記載了語言本身。也就是說，它處理的物件，以及表達式評估流程的詳細資訊，在編寫 R 函式時會很有用。 | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB |
| R 內部結構：R 內部結構指南，以及核心團隊在 R 本身上工作的編碼標準。 | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB | HTML | PDF | EPUB |
| R 參考索引：包含所有 R 標準和建議套件的說明檔案，以可列印格式提供。（9MB，約 3500 頁） |
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這些文件的最新版本之 LaTeX 或 Texinfo 原始碼包含在每個 R 原始碼發行版中（在解壓縮的檔案之 doc/manual 子目錄中）。手冊的舊版本可以在各自的 R 原始碼檔案 中找到。手冊的 HTML 版本也是大多數 R 安裝的一部分（可以使用函數 help.start() 存取）。
請在回報已發布版本的任何問題之前，查看 R-devel 的手冊。